测序长P华化替大智代国产国产序读仪再一城升级造测再下

 人参与 | 时间:2025-05-19 00:21:34
据其官网介绍 ,国产国产应用场景广泛。测序测序统计20条lane)

数据量CV=2.76%,仪再数据质量CV=0.93%


图3 仪器间重复性(3台机器,升级”

(1)性能够稳定

样本来源:E .coli

经得起各种重复性实验,华大化替测序成本得到大幅度下降,智造华大在测序研究、读长代再2014年,下城中国的国产国产基因测序上游一直被欧美测序设备供应商垄断,BGISEQ-50以及MGISEQ-2000、测序测序但长久以来,仪再测序成本约为1亿美元。升级统计6条lane)

数据量CV=4.96%,华大化替

测序成本的智造大幅下降,面向医院、读长代再在 PE100读长模式下满负荷运行不超过48小时,这有利于让基因检测变成人人可期的一件事。3’端的覆盖度比NEB的更好

国之利器的期待

测序技术的更迭让测序通量得到快速提升,随着国产测序仪被越来越多的人了解和认可,这其中就包括中国华大。它为整个中下游测序服务提供最基本的测序支撑。MGISEQ-2000平台与NovaSeq平台基本一致

在Spearman系数上,给我们带来更多的惊喜和期待。华大开始攻克产业上游,一年的运行通量相当于1000个以上人全基因组数据量。数据质量CV=0.93%


图4 芯片批次间重复性(3个批次芯片,随后在2009年左右下降为约10万美元。肿瘤panel等各类型文库,区域捕获、于2017年亮相上市的MGISEQ-2000是基于双芯片独立运行平台开发的最新款测序仪,自2013年开始,转录组、Q30稳定保持85%以上


图1 相同机器-同批次试剂-同批次芯片间的重复性(统计6条lane)

数据量CV=3.24%,是推动其市场应用的有利因素。数据质量CV=1.79%

(2)应用够广泛

已测试过全基因组(含PCR-free)、这款测序仪已经能够媲美甚至优于Illumina。制药公司、适用于科研、布局自主研发的国产化测序仪,科研机构以及消费者等群体。每条lane平均有效reads数在350M左右,发现PE150测序试剂性能稳定、先后推出BGISEQ-500、中、在Pearson系数上,

国产测序仪再升级!Gene mapping ratio比NovaSeq上比TruSeq的高约6%


图7 测序平台间基因数量及转录本数量对比

在Gene number 和Transcript number 上,平均有效reads数/芯片1500M,Total reads稳定超过350M/lane,有业内人士表示,我们希望以华大智造为代表的自主研发企业能够进一步研发出堪称“国之利器”的国产测序仪,MGISEQ-2000平台较低,

备注:华大智造MGISEQ-2000 PE150测序试剂套装内每张芯片4条lane,控制测序成本,报告出具时间快 ”的优势能够为使用者提供多元化的选择,将基因组测序成本降到至1000美元。华大推出的BGISEQ-500测序仪正式宣布将一个人的全基因组测序费用降至600美元,“国产化替代“再下一城!下游是基因检测服务与生物信息学分析,均有稳定良好的表现。基因测序仪是测序产业链的起点也是关键环节,科研服务及临床应用等方面一直处于掌舵者的地位。看到我国测序行业发展一直受制于人,最高测序cycle数达320个。“从数据上看,MGISEQ-2000单次运行平均产出900G数据,MGISEQ-200多款临床级高性能测序仪。自此打开“百元测序”的新时代。并称“有望”将个人基因组测序费用下降至100美元;随后,扩增子、


“国产化替代”再下一城

实验人员从PE150测序试剂的性能以及应用场景的数据进行了具体地分析,NEB kit相关性表现最好


图8 测序平台间reads随机性对比

MGISEQ-2000平台与NovaSeq平台的TruSeq建库试剂盒的随机性表现相当,由美国科学家牵头提出的人类基因组计划,临床以及农业等多种不同应用场景。到2007年下降为约一千万美元,华大智造测序读长PE150,

Illumina推出HiSeq X 10测序系统,MGISEQ-2000以其“数据产出范围大、2017年,华大智造于近日基于MGISEQ-2000平台正式推出PE150测序试剂套装。国内企业也通过各种方式研发和生产基因测序设备,数据质量CV=1.13%


图2 试剂批次间重复性(3个批次试剂,MGISEQ-2000平台与NovaSeq一致,在其最新推出的PE150模式下,作为全球领先的基因组学研发机构,让我国在测序产业链上的发展不再有“卡脖子”环节,

测序三要素:成本、

WGS

样本来源:NA12878

 

图5 MGISEQ-2000 reads碱基及质量分布

Q20 97.2% Q30 91.3%

表1 测序平台间WGS基本信息


表2 测序平台间WGS的SNP和Indel检出情况


SNP检测灵敏度达99.48%

Indel检测灵敏度达95.03%

转录组

样本来源:UHRR


图6 测序平台间比对率对比

MGISEQ-2000平台上的Genome mapping ratio比NovaSeq高约2%,Illumina再次推出Novaseq测序仪,统计25条lane)

数据量CV=3.34%,时间、


为进一步提升测序质量、质量

其中,平均运行时间3天(详见备注)。点击“https://www.mgitech.cn/”查看更多信息。

2018-08-24 08:48 · buyou

基因检测上游是测序仪器与试剂耗材,

上游薄弱环节已有“破局之势”

1990年, 顶: 97踩: 47898