Jonathan Rothberg先后创办了454和Ion Torrent，专利Ion Torrent和赛默飞（在收购Ion Torrent时）都心知肚明，罗氏他违反了协议。起诉侵权文库制备试剂等都侵犯了这3项专利，赛默454宣称该侵权行为是专利“故意的”，被誉为生物科技领域的罗氏乔布斯
在起诉中，”因此，起诉侵权该诉讼的赛默原告名字是454，8765380。专利但是罗氏在创办Ion Torrent和开发Ion Torrent测序技术的过程中，他们起诉赛默飞旗下的起诉侵权Ion Torrent侵犯了他们的3项专利。他们起诉赛默飞旗下的赛默Ion Torrent侵犯了他们的3项专利。被告就已经知晓专利相关事宜了。因此，2004年Rothberg将所有专利的申请权交给了454，起诉书写道，454还声称，Rothberg不允许对454乳液PCR专利的有效性和可执行性提出质疑。客户对这些产品的使用也构成了对专利的侵犯。并表示将在2016年淘汰454测序仪。Ion Chef，起诉书上写道：“Jonathan Rothberg利用这项已授权给454的技术创立了Ion Torrent，
454请求损害赔偿，同时被告没有权利质疑专利的有效性或可执行性。454说，这3项专利都与测序前样本处理使用到的一项技术——微乳液PCR有关。罗氏454将赛默飞世尔告上法庭，自2013年，提出一项为制约Ion Torrent进一步侵权而制定的永久禁令。
罗氏454将赛默飞世尔告上法庭，
此外，Proton测序仪、这些产品“大量使用到微乳液PCR技术”。Ion Torrent的样本制备系统——包括Ion OneTouch 2、而非“罗氏”。赛默飞和罗氏都拒绝对诉讼发表评论。罗氏开始逐渐关闭454业务，早在2012年开始进行的一项许可证讨论的时候，Ion Torrent的前CEO Jonathan Rothberg是这3项侵权专利的发明者。
根据提交给美国特拉华州地区法院的文件显示，微乳液PCR技术是一直是属于454的。
近日，
除了专利侵权，8748102、并将该技术商业化。值得注意的是，专利号（美国）分别为7323305、以及Ion PGM、454声称，这3项专利都与测序前样本处理使用到的一项技术——微乳液PCR有关，并提出一项为制约Ion Torrent进一步侵权而制定的永久禁令。